台北故宮藏有書畫總計9120件，據介紹其中一半為優等和次等，元以前繪畫574件(不包括南薰殿宋以前帝後像)，元以前書法155件。北京故宮有書畫15萬件左右，約佔世界公立博物館所藏中國古代書畫的¼，其中約1/3具有較高的學術價值和欣賞價值，有近420件元以前的繪畫，310件元以前的書法。元以前書畫總收藏量，數量上北京故宮低于台北故宮。但相對嚴格的鑒定工作，使得北京故宮早期(元以前)書畫中，很少有早期和晚期(明清)之爭。在繪畫的時代方面，北京故宮的早期藏品反映了各個歷史時期的繪畫面貌，特別是東晉顧愷之的兩件北宋摹本《列女圖》卷和《洛神賦圖》卷真實地反映了漢魏六朝時期的繪畫風格。就唐、五代、兩宋繪畫而言，台北故宮在數量上較北京故宮要多，但北京故宮元代繪畫眾多的收藏量和完善的品質堪稱世界之冠。就宋代繪畫而言，台北故宮的山水畫珍品多于北京故宮，但北京故宮的人物畫珍品則佔有重要地位。北京故宮繪畫藏品種類較全面，除卷軸畫外，還藏有版畫、年畫、清宮油畫、玻璃畫、屏風畫、貼落等，這些是台北故宮所缺乏和不足的。此外北京故宮還有10件唐宋壁畫、7件唐五代敦煌紙絹畫、1鋪元代大幅壁畫等。北京故宮庋藏的明清大幅宮廷書畫也是台北故宮所缺少的，因為這些在文物南遷時有一定運輸難度。由于台北故宮主要接收的是清宮舊藏歷代書畫，而18、19世紀的“揚州八怪”、“京江畫派”、清初的“金陵諸家”、“四僧”等許多流派的繪畫和書法為清宮所缺，如今已是國之重寶。北京故宮于上世紀60年代初已將上述幾個時期書畫收藏齊備。在書法方面，台北故宮的收藏量和品質不如北京故宮。北京故宮有4萬多通明清尺牘，其中蘊含著巨大的文獻價值和藝術價值，遠勝台北故宮在這方面的收藏。在碑帖方面，北京故宮的碑帖善本佔全國大多數。目前尚沒有見到文物南遷中有關碑帖的記錄。
二、陶瓷類文物。北京故宮有35萬件，一級品1100多件，二級品約5.6萬件，還有上世紀以來在全國110多個窯口所採集的3萬餘片陶瓷標本。台北故宮有25248件清宮舊藏瓷器，宋代五大名窯瓷器及明代官窯瓷器收藏均佔優勢，著名的清代康雍乾三朝琺琅彩瓷器絕大多數都藏在台北故宮。但北京故宮的收藏數量是台北故宮無法比擬的，特別是在新石器時代彩陶、三國兩晉南北朝隋唐五代瓷器、清代嘉慶至宣統官窯瓷器、歷代民窯瓷器以及古陶瓷窯址標本、實物資料收藏方面，北京故宮均佔有明顯優勢。北京故宮在歷代官窯瓷器收藏方面，無論數量還是質量，也都相當可觀，不容忽視。在古陶瓷收藏方面，兩岸故宮各有千秋。
三、青銅器方面。北京故宮藏歷代銅器1.5萬餘件，其中先秦青銅器約1萬件，有銘文的1600餘件，這三個數量均佔中外傳世與出土數量總和的1/10以上，是國內外收藏中國青銅器數量最多的博物館。另外有歷代貨幣1萬餘枚、銅鏡4000面、印押1萬餘件。台北故宮收藏有5615件青銅器，先秦有銘文的約500件。兩岸故宮青銅器都以傳世品為主，台北故宮藏品的總量和精品數量都較少，但毛公鼎、散氏盤、宗周鍾等重器則十分有名。
四、工藝類藏品方面。北京故宮藏有玉器28461件，數量上多于台北故宮的11445件，而且又征集了考古發掘出土的珍貴玉器數百件，其中安徽凌家灘遺址與六安楊公鄉戰國墓出土的一些玉器，為世所罕見，目前僅北京故宮有收藏。另外，北京故宮的“大禹治水”玉山，重逾萬斤，還有重量數千斤的幾件玉山，是台北故宮所不能及的。漆器、琺琅、玻璃、金銀器、竹木牙角雕刻，以及筆墨紙硯等“雜項”，台北故宮總計7605件，北京故宮則有101355件。漆器整體上台北故宮精品較少;金屬琺琅器，兩岸所藏特點相近，但北京故宮的一些大型金屬琺琅製品則是台北故宮所沒有的;從台北故宮出版的有關如意、文玩等出版物所選文物看，其工藝水準明顯遜于北京故宮藏品。另外，北京故宮還藏盆景1442件，匏器590件，而台北故宮無此收藏。